Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK7P50613 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK7P50613 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK7P50613 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK7P50613 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK7P50613 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK7P50613 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK7P50613 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK7P50613 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK7P50613 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK7P50613 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK7P50613 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK7P50613 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK7P50613 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK7P50613 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK7P50613 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK7P50613 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK7P50613 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK7P50613 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK7P50613 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK7P50613 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK7P50613 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK7P50613 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK7P50613 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK7P50613 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK7P50613 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK7P50613 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK7P50613 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK7P50613 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK7P50613 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK7P50613 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK7P50613 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK7P50613 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK7P50613 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK7P50613 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK7P50613 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK7P50613 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK7P50613 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK7P50613 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK7P50613 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK7P50613 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK7P50613 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK7P50613 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK7P50613 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK7P50613 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK7P50613 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK7P50613 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK7P50613 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK7P50613 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK7P50613 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK7P50613 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK7P50613 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK7P50613 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK7P50613 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK7P50613 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK7P50613 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK7P50613 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDK7P50613 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK7P50613 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK7P50613 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK7P50613 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK7P50613 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK7P50613 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK7P50613 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK7P50613 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK7P50613 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK7P50613 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK7P50613 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK7P50613 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK7P50613 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK7P50613 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK7P50613 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK7P50613 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK7P50613 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK7P50613 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK7P50613 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK7P50613 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK7P50613 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK7P50613 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK7P50613 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK7P50613 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK7P50613 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK7P50613 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK7P50613 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK7P50613 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK7P50613 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK7P50613 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK7P50613 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK7P50613 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK7P50613 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK7P50613 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK7P50613 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK7P50613 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK7P50613 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK7P50613 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK7P50613 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK7P50613 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK7P50613 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK7P50613 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK7P50613 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms