Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CRIP1P50238 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CRIP1P50238 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms