Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MRE11P49959 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MRE11P49959 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MRE11P49959 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MRE11P49959 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MRE11P49959 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MRE11P49959 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MRE11P49959 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MRE11P49959 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MRE11P49959 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MRE11P49959 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MRE11P49959 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MRE11P49959 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MRE11P49959 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MRE11P49959 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MRE11P49959 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MRE11P49959 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MRE11P49959 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MRE11P49959 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MRE11P49959 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRE11P49959 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MRE11P49959 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRE11P49959 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRE11P49959 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRE11P49959 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRE11P49959 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRE11P49959 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MRE11P49959 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRE11P49959 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRE11P49959 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRE11P49959 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRE11P49959 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRE11P49959 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRE11P49959 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRE11P49959 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRE11P49959 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRE11P49959 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRE11P49959 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRE11P49959 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MRE11P49959 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MRE11P49959 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MRE11P49959 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MRE11P49959 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MRE11P49959 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MRE11P49959 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MRE11P49959 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MRE11P49959 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRE11P49959 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRE11P49959 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRE11P49959 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRE11P49959 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRE11P49959 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRE11P49959 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRE11P49959 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRE11P49959 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRE11P49959 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRE11P49959 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRE11P49959 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRE11P49959 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MRE11P49959 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MRE11P49959 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MRE11P49959 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MRE11P49959 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MRE11P49959 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MRE11P49959 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MRE11P49959 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MRE11P49959 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MRE11P49959 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRE11P49959 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRE11P49959 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRE11P49959 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRE11P49959 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRE11P49959 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRE11P49959 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRE11P49959 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRE11P49959 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRE11P49959 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MRE11P49959 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MRE11P49959 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MRE11P49959 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MRE11P49959 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MRE11P49959 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MRE11P49959 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MRE11P49959 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MRE11P49959 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MRE11P49959 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MRE11P49959 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MRE11P49959 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MRE11P49959 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MRE11P49959 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MRE11P49959 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MRE11P49959 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MRE11P49959 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MRE11P49959 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MRE11P49959 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MRE11P49959 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MRE11P49959 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MRE11P49959 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MRE11P49959 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
MRE11P49959 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms