Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF6P49848 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF6P49848 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF6P49848 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF6P49848 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF6P49848 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF6P49848 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF6P49848 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF6P49848 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF6P49848 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF6P49848 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF6P49848 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF6P49848 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF6P49848 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF6P49848 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF6P49848 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF6P49848 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF6P49848 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF6P49848 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF6P49848 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF6P49848 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF6P49848 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF6P49848 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF6P49848 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF6P49848 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF6P49848 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF6P49848 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF6P49848 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF6P49848 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF6P49848 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF6P49848 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF6P49848 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF6P49848 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF6P49848 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF6P49848 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF6P49848 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF6P49848 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF6P49848 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF6P49848 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF6P49848 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF6P49848 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF6P49848 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF6P49848 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF6P49848 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF6P49848 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF6P49848 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF6P49848 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF6P49848 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF6P49848 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF6P49848 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF6P49848 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF6P49848 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF6P49848 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF6P49848 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF6P49848 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF6P49848 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF6P49848 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF6P49848 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF6P49848 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF6P49848 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF6P49848 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF6P49848 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF6P49848 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF6P49848 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF6P49848 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF6P49848 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF6P49848 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF6P49848 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF6P49848 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF6P49848 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF6P49848 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF6P49848 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF6P49848 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF6P49848 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF6P49848 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF6P49848 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF6P49848 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF6P49848 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF6P49848 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF6P49848 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF6P49848 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF6P49848 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF6P49848 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF6P49848 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF6P49848 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF6P49848 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF6P49848 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF6P49848 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF6P49848 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF6P49848 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF6P49848 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF6P49848 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF6P49848 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF6P49848 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF6P49848 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF6P49848 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF6P49848 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF6P49848 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF6P49848 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF6P49848 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms