Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSEN1P49768 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSEN1P49768 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms