Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LHX1P48742 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LHX1P48742 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LHX1P48742 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LHX1P48742 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LHX1P48742 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LHX1P48742 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX1P48742 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX1P48742 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX1P48742 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX1P48742 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX1P48742 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX1P48742 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX1P48742 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX1P48742 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX1P48742 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX1P48742 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX1P48742 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX1P48742 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LHX1P48742 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LHX1P48742 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LHX1P48742 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LHX1P48742 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LHX1P48742 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LHX1P48742 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LHX1P48742 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LHX1P48742 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LHX1P48742 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LHX1P48742 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LHX1P48742 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LHX1P48742 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LHX1P48742 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LHX1P48742 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LHX1P48742 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LHX1P48742 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LHX1P48742 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX1P48742 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX1P48742 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX1P48742 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX1P48742 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX1P48742 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX1P48742 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX1P48742 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX1P48742 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX1P48742 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX1P48742 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX1P48742 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX1P48742 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX1P48742 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX1P48742 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX1P48742 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX1P48742 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX1P48742 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX1P48742 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX1P48742 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX1P48742 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX1P48742 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX1P48742 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LHX1P48742 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LHX1P48742 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LHX1P48742 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LHX1P48742 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LHX1P48742 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LHX1P48742 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LHX1P48742 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LHX1P48742 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX1P48742 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX1P48742 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX1P48742 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX1P48742 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX1P48742 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX1P48742 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX1P48742 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX1P48742 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX1P48742 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX1P48742 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LHX1P48742 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LHX1P48742 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LHX1P48742 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LHX1P48742 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LHX1P48742 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LHX1P48742 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LHX1P48742 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LHX1P48742 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LHX1P48742 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LHX1P48742 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LHX1P48742 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LHX1P48742 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LHX1P48742 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LHX1P48742 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LHX1P48742 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LHX1P48742 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LHX1P48742 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LHX1P48742 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX1P48742 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX1P48742 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX1P48742 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LHX1P48742 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LHX1P48742 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LHX1P48742 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms