Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT5P48643 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT5P48643 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT5P48643 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT5P48643 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT5P48643 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT5P48643 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT5P48643 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT5P48643 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT5P48643 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT5P48643 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT5P48643 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT5P48643 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCT5P48643 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCT5P48643 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCT5P48643 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCT5P48643 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCT5P48643 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCT5P48643 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCT5P48643 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCT5P48643 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCT5P48643 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCT5P48643 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCT5P48643 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCT5P48643 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCT5P48643 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT5P48643 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT5P48643 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT5P48643 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT5P48643 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT5P48643 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT5P48643 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT5P48643 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT5P48643 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCT5P48643 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCT5P48643 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCT5P48643 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCT5P48643 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCT5P48643 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCT5P48643 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCT5P48643 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCT5P48643 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCT5P48643 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCT5P48643 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCT5P48643 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCT5P48643 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCT5P48643 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCT5P48643 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCT5P48643 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCT5P48643 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCT5P48643 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCT5P48643 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCT5P48643 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCT5P48643 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCT5P48643 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCT5P48643 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCT5P48643 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCT5P48643 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCT5P48643 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCT5P48643 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCT5P48643 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCT5P48643 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCT5P48643 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCT5P48643 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCT5P48643 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCT5P48643 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCT5P48643 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCT5P48643 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCT5P48643 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCT5P48643 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCT5P48643 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCT5P48643 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCT5P48643 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCT5P48643 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCT5P48643 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCT5P48643 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCT5P48643 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCT5P48643 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCT5P48643 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCT5P48643 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCT5P48643 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCT5P48643 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCT5P48643 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCT5P48643 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCT5P48643 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCT5P48643 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCT5P48643 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCT5P48643 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCT5P48643 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCT5P48643 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCT5P48643 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCT5P48643 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCT5P48643 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCT5P48643 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCT5P48643 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCT5P48643 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCT5P48643 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCT5P48643 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCT5P48643 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCT5P48643 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 557.4 ms