Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA8P48165 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA8P48165 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA8P48165 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GJA8P48165 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA8P48165 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA8P48165 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA8P48165 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA8P48165 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA8P48165 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJA8P48165 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
GJA8P48165 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJA8P48165 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJA8P48165 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJA8P48165 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJA8P48165 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJA8P48165 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJA8P48165 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJA8P48165 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJA8P48165 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJA8P48165 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJA8P48165 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJA8P48165 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJA8P48165 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJA8P48165 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA8P48165 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA8P48165 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA8P48165 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA8P48165 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA8P48165 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA8P48165 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA8P48165 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA8P48165 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA8P48165 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJA8P48165 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJA8P48165 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJA8P48165 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJA8P48165 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJA8P48165 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJA8P48165 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJA8P48165 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJA8P48165 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJA8P48165 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJA8P48165 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA8P48165 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA8P48165 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA8P48165 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA8P48165 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA8P48165 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA8P48165 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA8P48165 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA8P48165 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA8P48165 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA8P48165 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA8P48165 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA8P48165 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA8P48165 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA8P48165 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA8P48165 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA8P48165 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA8P48165 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA8P48165 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA8P48165 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA8P48165 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA8P48165 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA8P48165 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA8P48165 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA8P48165 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA8P48165 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GJA8P48165 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA8P48165 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA8P48165 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA8P48165 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA8P48165 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA8P48165 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA8P48165 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA8P48165 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA8P48165 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA8P48165 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA8P48165 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA8P48165 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA8P48165 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA8P48165 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA8P48165 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA8P48165 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA8P48165 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA8P48165 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA8P48165 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA8P48165 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA8P48165 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA8P48165 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA8P48165 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA8P48165 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA8P48165 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA8P48165 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA8P48165 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJA8P48165 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJA8P48165 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJA8P48165 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJA8P48165 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms