Protein–RNA interactions for Protein: P47804

RGR, RPE-retinal G protein-coupled receptor, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGRP47804 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGRP47804 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGRP47804 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGRP47804 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGRP47804 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGRP47804 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGRP47804 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGRP47804 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RGRP47804 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGRP47804 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGRP47804 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RGRP47804 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RGRP47804 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RGRP47804 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RGRP47804 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RGRP47804 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RGRP47804 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RGRP47804 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGRP47804 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGRP47804 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGRP47804 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGRP47804 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGRP47804 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGRP47804 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGRP47804 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGRP47804 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGRP47804 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGRP47804 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGRP47804 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGRP47804 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGRP47804 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGRP47804 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGRP47804 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGRP47804 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGRP47804 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RGRP47804 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGRP47804 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGRP47804 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGRP47804 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RGRP47804 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGRP47804 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGRP47804 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGRP47804 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGRP47804 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGRP47804 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGRP47804 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGRP47804 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGRP47804 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGRP47804 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGRP47804 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGRP47804 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGRP47804 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGRP47804 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGRP47804 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGRP47804 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGRP47804 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGRP47804 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGRP47804 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGRP47804 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGRP47804 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGRP47804 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGRP47804 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RGRP47804 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGRP47804 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGRP47804 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGRP47804 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGRP47804 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGRP47804 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGRP47804 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGRP47804 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGRP47804 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGRP47804 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGRP47804 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGRP47804 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGRP47804 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGRP47804 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGRP47804 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RGRP47804 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGRP47804 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGRP47804 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGRP47804 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGRP47804 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGRP47804 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGRP47804 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGRP47804 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGRP47804 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGRP47804 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGRP47804 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGRP47804 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGRP47804 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGRP47804 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGRP47804 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGRP47804 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGRP47804 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGRP47804 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGRP47804 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGRP47804 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGRP47804 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGRP47804 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGRP47804 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms