Protein–RNA interactions for Protein: P46059

SLC15A1, Solute carrier family 15 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC15A1P46059 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC15A1P46059 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC15A1P46059 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms