Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AFMP43652 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFMP43652 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFMP43652 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFMP43652 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFMP43652 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFMP43652 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFMP43652 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFMP43652 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFMP43652 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFMP43652 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFMP43652 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFMP43652 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFMP43652 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFMP43652 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFMP43652 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFMP43652 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFMP43652 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFMP43652 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFMP43652 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AFMP43652 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AFMP43652 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AFMP43652 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AFMP43652 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
AFMP43652 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
AFMP43652 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
AFMP43652 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
AFMP43652 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AFMP43652 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AFMP43652 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AFMP43652 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AFMP43652 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AFMP43652 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AFMP43652 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFMP43652 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFMP43652 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFMP43652 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFMP43652 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
AFMP43652 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFMP43652 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AFMP43652 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AFMP43652 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AFMP43652 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AFMP43652 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AFMP43652 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AFMP43652 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AFMP43652 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
AFMP43652 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AFMP43652 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
AFMP43652 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AFMP43652 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AFMP43652 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AFMP43652 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AFMP43652 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AFMP43652 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AFMP43652 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AFMP43652 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AFMP43652 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AFMP43652 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AFMP43652 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AFMP43652 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFMP43652 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFMP43652 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFMP43652 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFMP43652 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFMP43652 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFMP43652 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFMP43652 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFMP43652 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFMP43652 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFMP43652 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFMP43652 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFMP43652 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFMP43652 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFMP43652 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AFMP43652 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AFMP43652 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AFMP43652 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
AFMP43652 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AFMP43652 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AFMP43652 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AFMP43652 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AFMP43652 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AFMP43652 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AFMP43652 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AFMP43652 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AFMP43652 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AFMP43652 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AFMP43652 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AFMP43652 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AFMP43652 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AFMP43652 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AFMP43652 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AFMP43652 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AFMP43652 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AFMP43652 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AFMP43652 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AFMP43652 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AFMP43652 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AFMP43652 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms