Protein–RNA interactions for Protein: P43405

SYK, Tyrosine-protein kinase SYK, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYKP43405 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYKP43405 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYKP43405 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYKP43405 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYKP43405 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYKP43405 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYKP43405 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYKP43405 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYKP43405 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYKP43405 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYKP43405 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYKP43405 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYKP43405 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYKP43405 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYKP43405 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYKP43405 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYKP43405 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYKP43405 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SYKP43405 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYKP43405 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SYKP43405 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYKP43405 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SYKP43405 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYKP43405 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYKP43405 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYKP43405 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYKP43405 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYKP43405 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYKP43405 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYKP43405 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYKP43405 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYKP43405 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYKP43405 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYKP43405 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYKP43405 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYKP43405 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYKP43405 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYKP43405 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYKP43405 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYKP43405 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYKP43405 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYKP43405 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYKP43405 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYKP43405 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYKP43405 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYKP43405 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYKP43405 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYKP43405 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYKP43405 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYKP43405 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYKP43405 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYKP43405 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYKP43405 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYKP43405 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYKP43405 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYKP43405 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYKP43405 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYKP43405 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYKP43405 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYKP43405 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYKP43405 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYKP43405 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYKP43405 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYKP43405 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYKP43405 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYKP43405 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYKP43405 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYKP43405 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYKP43405 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYKP43405 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYKP43405 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYKP43405 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYKP43405 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYKP43405 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYKP43405 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYKP43405 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYKP43405 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYKP43405 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SYKP43405 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SYKP43405 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYKP43405 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYKP43405 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYKP43405 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYKP43405 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYKP43405 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYKP43405 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYKP43405 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYKP43405 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYKP43405 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYKP43405 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYKP43405 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYKP43405 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYKP43405 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYKP43405 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYKP43405 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYKP43405 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYKP43405 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYKP43405 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYKP43405 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYKP43405 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms