Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CBP42338 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3CBP42338 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms