Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIA1P42261 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIA1P42261 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms