Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC19A1P41440 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC19A1P41440 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms