Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARL4AP40617 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARL4AP40617 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms