Protein–RNA interactions for Protein: P40429

RPL13A, 60S ribosomal protein L13a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP40429 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPL13AP40429 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms