Protein–RNA interactions for Protein: P40337

VHL, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHLP40337 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VHLP40337 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VHLP40337 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VHLP40337 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VHLP40337 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VHLP40337 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VHLP40337 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VHLP40337 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VHLP40337 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VHLP40337 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VHLP40337 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VHLP40337 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VHLP40337 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VHLP40337 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VHLP40337 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VHLP40337 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VHLP40337 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VHLP40337 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VHLP40337 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VHLP40337 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VHLP40337 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VHLP40337 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VHLP40337 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VHLP40337 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VHLP40337 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VHLP40337 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VHLP40337 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VHLP40337 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VHLP40337 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
VHLP40337 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VHLP40337 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VHLP40337 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VHLP40337 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VHLP40337 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VHLP40337 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VHLP40337 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VHLP40337 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VHLP40337 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VHLP40337 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VHLP40337 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VHLP40337 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VHLP40337 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VHLP40337 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VHLP40337 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VHLP40337 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VHLP40337 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VHLP40337 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VHLP40337 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VHLP40337 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VHLP40337 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VHLP40337 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VHLP40337 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VHLP40337 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VHLP40337 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VHLP40337 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VHLP40337 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VHLP40337 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VHLP40337 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VHLP40337 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VHLP40337 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VHLP40337 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VHLP40337 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VHLP40337 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VHLP40337 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VHLP40337 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VHLP40337 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VHLP40337 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VHLP40337 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VHLP40337 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VHLP40337 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VHLP40337 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VHLP40337 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VHLP40337 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VHLP40337 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VHLP40337 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VHLP40337 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VHLP40337 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VHLP40337 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VHLP40337 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VHLP40337 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VHLP40337 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VHLP40337 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VHLP40337 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VHLP40337 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VHLP40337 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VHLP40337 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VHLP40337 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VHLP40337 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VHLP40337 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VHLP40337 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VHLP40337 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VHLP40337 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VHLP40337 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VHLP40337 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VHLP40337 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VHLP40337 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VHLP40337 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VHLP40337 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VHLP40337 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VHLP40337 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms