Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
THPOP40225 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
THPOP40225 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
THPOP40225 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
THPOP40225 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
THPOP40225 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
THPOP40225 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
THPOP40225 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
THPOP40225 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
THPOP40225 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
THPOP40225 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
THPOP40225 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
THPOP40225 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
THPOP40225 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
THPOP40225 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
THPOP40225 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
THPOP40225 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
THPOP40225 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
THPOP40225 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
THPOP40225 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
THPOP40225 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
THPOP40225 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
THPOP40225 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
THPOP40225 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
THPOP40225 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
THPOP40225 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
THPOP40225 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
THPOP40225 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
THPOP40225 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
THPOP40225 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
THPOP40225 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
THPOP40225 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
THPOP40225 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
THPOP40225 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
THPOP40225 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
THPOP40225 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
THPOP40225 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
THPOP40225 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
THPOP40225 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
THPOP40225 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
THPOP40225 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
THPOP40225 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
THPOP40225 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
THPOP40225 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
THPOP40225 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
THPOP40225 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
THPOP40225 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
THPOP40225 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
THPOP40225 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
THPOP40225 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
THPOP40225 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
THPOP40225 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
THPOP40225 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
THPOP40225 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
THPOP40225 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
THPOP40225 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
THPOP40225 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
THPOP40225 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
THPOP40225 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
THPOP40225 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
THPOP40225 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
THPOP40225 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
THPOP40225 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
THPOP40225 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
THPOP40225 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
THPOP40225 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
THPOP40225 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
THPOP40225 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THPOP40225 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THPOP40225 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
THPOP40225 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THPOP40225 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
THPOP40225 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THPOP40225 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THPOP40225 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THPOP40225 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
THPOP40225 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
THPOP40225 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
THPOP40225 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
THPOP40225 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
THPOP40225 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
THPOP40225 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
THPOP40225 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
THPOP40225 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
THPOP40225 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
THPOP40225 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
THPOP40225 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
THPOP40225 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
THPOP40225 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
THPOP40225 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
THPOP40225 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
THPOP40225 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
THPOP40225 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
THPOP40225 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
THPOP40225 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
THPOP40225 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
THPOP40225 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
THPOP40225 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
THPOP40225 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
THPOP40225 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms