Protein–RNA interactions for Protein: P39900

MMP12, Macrophage metalloelastase, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP12P39900 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP12P39900 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP12P39900 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP12P39900 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP12P39900 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP12P39900 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP12P39900 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP12P39900 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP12P39900 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP12P39900 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP12P39900 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP12P39900 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP12P39900 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP12P39900 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP12P39900 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP12P39900 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP12P39900 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP12P39900 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP12P39900 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP12P39900 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP12P39900 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP12P39900 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP12P39900 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP12P39900 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP12P39900 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP12P39900 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP12P39900 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP12P39900 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP12P39900 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MMP12P39900 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MMP12P39900 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MMP12P39900 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MMP12P39900 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MMP12P39900 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MMP12P39900 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP12P39900 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP12P39900 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP12P39900 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP12P39900 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP12P39900 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP12P39900 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP12P39900 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP12P39900 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP12P39900 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP12P39900 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP12P39900 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP12P39900 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP12P39900 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP12P39900 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP12P39900 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP12P39900 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP12P39900 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP12P39900 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP12P39900 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP12P39900 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP12P39900 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP12P39900 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP12P39900 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP12P39900 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP12P39900 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP12P39900 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP12P39900 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP12P39900 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP12P39900 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP12P39900 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP12P39900 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP12P39900 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP12P39900 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP12P39900 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP12P39900 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP12P39900 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP12P39900 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP12P39900 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP12P39900 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP12P39900 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP12P39900 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP12P39900 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP12P39900 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP12P39900 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP12P39900 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP12P39900 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP12P39900 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP12P39900 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP12P39900 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP12P39900 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP12P39900 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP12P39900 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP12P39900 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP12P39900 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP12P39900 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MMP12P39900 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MMP12P39900 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MMP12P39900 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP12P39900 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP12P39900 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP12P39900 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP12P39900 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP12P39900 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP12P39900 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP12P39900 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms