Protein–RNA interactions for Protein: P39023

RPL3, 60S ribosomal protein L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3P39023 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL3P39023 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL3P39023 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL3P39023 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL3P39023 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL3P39023 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL3P39023 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL3P39023 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL3P39023 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL3P39023 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL3P39023 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL3P39023 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL3P39023 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL3P39023 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL3P39023 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL3P39023 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL3P39023 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL3P39023 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL3P39023 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL3P39023 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL3P39023 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL3P39023 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL3P39023 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL3P39023 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL3P39023 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL3P39023 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL3P39023 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL3P39023 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL3P39023 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL3P39023 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL3P39023 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL3P39023 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL3P39023 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL3P39023 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL3P39023 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL3P39023 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL3P39023 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL3P39023 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL3P39023 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL3P39023 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL3P39023 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL3P39023 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL3P39023 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL3P39023 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL3P39023 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL3P39023 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL3P39023 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL3P39023 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL3P39023 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL3P39023 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL3P39023 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL3P39023 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL3P39023 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL3P39023 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL3P39023 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL3P39023 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL3P39023 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL3P39023 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL3P39023 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL3P39023 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL3P39023 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL3P39023 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL3P39023 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL3P39023 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL3P39023 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL3P39023 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL3P39023 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL3P39023 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL3P39023 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL3P39023 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL3P39023 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL3P39023 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL3P39023 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL3P39023 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL3P39023 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL3P39023 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL3P39023 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL3P39023 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL3P39023 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL3P39023 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL3P39023 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL3P39023 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL3P39023 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL3P39023 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL3P39023 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL3P39023 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL3P39023 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL3P39023 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL3P39023 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL3P39023 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL3P39023 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL3P39023 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL3P39023 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL3P39023 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL3P39023 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL3P39023 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL3P39023 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL3P39023 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL3P39023 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL3P39023 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms