Protein–RNA interactions for Protein: P35408

PTGER4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER4P35408 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGER4P35408 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGER4P35408 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGER4P35408 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGER4P35408 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGER4P35408 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGER4P35408 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGER4P35408 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGER4P35408 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGER4P35408 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGER4P35408 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGER4P35408 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGER4P35408 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGER4P35408 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGER4P35408 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGER4P35408 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGER4P35408 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGER4P35408 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGER4P35408 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PTGER4P35408 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTGER4P35408 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTGER4P35408 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTGER4P35408 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGER4P35408 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGER4P35408 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGER4P35408 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGER4P35408 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGER4P35408 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGER4P35408 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGER4P35408 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGER4P35408 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGER4P35408 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTGER4P35408 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGER4P35408 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGER4P35408 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGER4P35408 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGER4P35408 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms