Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RORAP35398 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RORAP35398 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RORAP35398 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RORAP35398 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RORAP35398 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RORAP35398 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RORAP35398 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RORAP35398 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RORAP35398 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RORAP35398 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RORAP35398 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RORAP35398 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RORAP35398 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RORAP35398 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RORAP35398 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RORAP35398 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RORAP35398 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RORAP35398 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RORAP35398 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RORAP35398 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RORAP35398 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RORAP35398 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RORAP35398 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RORAP35398 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RORAP35398 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RORAP35398 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RORAP35398 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RORAP35398 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RORAP35398 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RORAP35398 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RORAP35398 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RORAP35398 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RORAP35398 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RORAP35398 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RORAP35398 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RORAP35398 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RORAP35398 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RORAP35398 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RORAP35398 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RORAP35398 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RORAP35398 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RORAP35398 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RORAP35398 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RORAP35398 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RORAP35398 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RORAP35398 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RORAP35398 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RORAP35398 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RORAP35398 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RORAP35398 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RORAP35398 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RORAP35398 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RORAP35398 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RORAP35398 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RORAP35398 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RORAP35398 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RORAP35398 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RORAP35398 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RORAP35398 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RORAP35398 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RORAP35398 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RORAP35398 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RORAP35398 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RORAP35398 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RORAP35398 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RORAP35398 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RORAP35398 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RORAP35398 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RORAP35398 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RORAP35398 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RORAP35398 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RORAP35398 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RORAP35398 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RORAP35398 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RORAP35398 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RORAP35398 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RORAP35398 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RORAP35398 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RORAP35398 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RORAP35398 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RORAP35398 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RORAP35398 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RORAP35398 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RORAP35398 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RORAP35398 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RORAP35398 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RORAP35398 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RORAP35398 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RORAP35398 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RORAP35398 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RORAP35398 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RORAP35398 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RORAP35398 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RORAP35398 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RORAP35398 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RORAP35398 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RORAP35398 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RORAP35398 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RORAP35398 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms