Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA4P35212 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA4P35212 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA4P35212 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA4P35212 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJA4P35212 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA4P35212 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA4P35212 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA4P35212 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA4P35212 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA4P35212 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA4P35212 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA4P35212 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA4P35212 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA4P35212 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJA4P35212 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA4P35212 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA4P35212 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA4P35212 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA4P35212 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA4P35212 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA4P35212 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA4P35212 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA4P35212 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA4P35212 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA4P35212 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA4P35212 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA4P35212 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA4P35212 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA4P35212 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA4P35212 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA4P35212 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA4P35212 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA4P35212 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA4P35212 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA4P35212 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA4P35212 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA4P35212 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA4P35212 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA4P35212 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA4P35212 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA4P35212 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA4P35212 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA4P35212 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA4P35212 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA4P35212 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA4P35212 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA4P35212 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA4P35212 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA4P35212 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA4P35212 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA4P35212 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA4P35212 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA4P35212 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA4P35212 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA4P35212 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA4P35212 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA4P35212 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA4P35212 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA4P35212 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA4P35212 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA4P35212 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA4P35212 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA4P35212 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA4P35212 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA4P35212 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA4P35212 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA4P35212 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA4P35212 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA4P35212 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA4P35212 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA4P35212 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA4P35212 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA4P35212 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA4P35212 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA4P35212 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA4P35212 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA4P35212 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA4P35212 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA4P35212 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA4P35212 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA4P35212 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA4P35212 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA4P35212 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA4P35212 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA4P35212 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA4P35212 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA4P35212 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA4P35212 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA4P35212 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA4P35212 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA4P35212 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA4P35212 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA4P35212 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA4P35212 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJA4P35212 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJA4P35212 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJA4P35212 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJA4P35212 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJA4P35212 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms