Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC1P35052 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC1P35052 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC1P35052 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC1P35052 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC1P35052 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC1P35052 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC1P35052 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC1P35052 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC1P35052 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC1P35052 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC1P35052 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC1P35052 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC1P35052 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC1P35052 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC1P35052 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC1P35052 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC1P35052 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC1P35052 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPC1P35052 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC1P35052 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC1P35052 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC1P35052 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC1P35052 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC1P35052 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPC1P35052 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC1P35052 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC1P35052 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC1P35052 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC1P35052 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC1P35052 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC1P35052 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC1P35052 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC1P35052 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC1P35052 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPC1P35052 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC1P35052 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC1P35052 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC1P35052 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC1P35052 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC1P35052 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC1P35052 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC1P35052 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC1P35052 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC1P35052 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC1P35052 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC1P35052 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC1P35052 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC1P35052 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC1P35052 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC1P35052 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC1P35052 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC1P35052 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC1P35052 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPC1P35052 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GPC1P35052 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GPC1P35052 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GPC1P35052 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GPC1P35052 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPC1P35052 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPC1P35052 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPC1P35052 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPC1P35052 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPC1P35052 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPC1P35052 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPC1P35052 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPC1P35052 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPC1P35052 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC1P35052 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC1P35052 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC1P35052 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC1P35052 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC1P35052 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC1P35052 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC1P35052 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC1P35052 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC1P35052 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC1P35052 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC1P35052 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPC1P35052 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC1P35052 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC1P35052 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC1P35052 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC1P35052 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC1P35052 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC1P35052 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC1P35052 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC1P35052 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC1P35052 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC1P35052 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC1P35052 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC1P35052 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPC1P35052 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC1P35052 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC1P35052 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC1P35052 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC1P35052 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC1P35052 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC1P35052 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPC1P35052 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms