Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GBP2P32456 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GBP2P32456 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GBP2P32456 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GBP2P32456 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GBP2P32456 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GBP2P32456 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GBP2P32456 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GBP2P32456 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP2P32456 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP2P32456 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP2P32456 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP2P32456 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP2P32456 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP2P32456 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP2P32456 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP2P32456 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP2P32456 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP2P32456 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP2P32456 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP2P32456 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP2P32456 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP2P32456 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP2P32456 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP2P32456 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP2P32456 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP2P32456 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP2P32456 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP2P32456 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP2P32456 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP2P32456 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP2P32456 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP2P32456 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP2P32456 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP2P32456 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP2P32456 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP2P32456 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP2P32456 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP2P32456 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP2P32456 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP2P32456 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP2P32456 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP2P32456 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP2P32456 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP2P32456 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP2P32456 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP2P32456 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP2P32456 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP2P32456 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP2P32456 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP2P32456 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP2P32456 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP2P32456 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP2P32456 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP2P32456 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP2P32456 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP2P32456 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP2P32456 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP2P32456 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP2P32456 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP2P32456 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP2P32456 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP2P32456 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP2P32456 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP2P32456 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP2P32456 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP2P32456 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP2P32456 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP2P32456 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP2P32456 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP2P32456 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP2P32456 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP2P32456 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP2P32456 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP2P32456 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP2P32456 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP2P32456 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP2P32456 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP2P32456 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP2P32456 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP2P32456 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP2P32456 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP2P32456 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP2P32456 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP2P32456 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP2P32456 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP2P32456 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP2P32456 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP2P32456 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP2P32456 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP2P32456 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP2P32456 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP2P32456 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP2P32456 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP2P32456 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP2P32456 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP2P32456 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP2P32456 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP2P32456 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP2P32456 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms