Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CXCR5P32302 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CXCR5P32302 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms