Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDC27P30260 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDC27P30260 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDC27P30260 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDC27P30260 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDC27P30260 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDC27P30260 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDC27P30260 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDC27P30260 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDC27P30260 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDC27P30260 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDC27P30260 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDC27P30260 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDC27P30260 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDC27P30260 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDC27P30260 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDC27P30260 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CDC27P30260 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CDC27P30260 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CDC27P30260 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDC27P30260 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDC27P30260 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDC27P30260 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC27P30260 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC27P30260 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC27P30260 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC27P30260 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC27P30260 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC27P30260 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC27P30260 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC27P30260 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC27P30260 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC27P30260 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC27P30260 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC27P30260 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC27P30260 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC27P30260 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDC27P30260 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDC27P30260 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDC27P30260 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDC27P30260 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDC27P30260 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDC27P30260 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDC27P30260 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDC27P30260 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDC27P30260 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDC27P30260 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDC27P30260 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDC27P30260 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDC27P30260 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDC27P30260 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDC27P30260 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDC27P30260 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDC27P30260 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDC27P30260 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDC27P30260 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDC27P30260 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDC27P30260 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDC27P30260 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDC27P30260 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDC27P30260 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDC27P30260 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDC27P30260 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDC27P30260 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDC27P30260 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDC27P30260 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CDC27P30260 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDC27P30260 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDC27P30260 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDC27P30260 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDC27P30260 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDC27P30260 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CDC27P30260 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDC27P30260 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDC27P30260 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDC27P30260 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDC27P30260 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDC27P30260 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDC27P30260 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDC27P30260 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDC27P30260 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDC27P30260 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDC27P30260 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDC27P30260 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDC27P30260 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDC27P30260 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDC27P30260 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDC27P30260 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDC27P30260 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC27P30260 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC27P30260 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC27P30260 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC27P30260 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC27P30260 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC27P30260 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC27P30260 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC27P30260 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC27P30260 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC27P30260 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC27P30260 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms