Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SERPINB3P29508 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SERPINB3P29508 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINB3P29508 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms