Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP1P29466 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP1P29466 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP1P29466 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP1P29466 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP1P29466 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP1P29466 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP1P29466 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP1P29466 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP1P29466 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP1P29466 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP1P29466 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP1P29466 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASP1P29466 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASP1P29466 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASP1P29466 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASP1P29466 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CASP1P29466 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASP1P29466 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CASP1P29466 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CASP1P29466 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CASP1P29466 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP1P29466 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP1P29466 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP1P29466 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP1P29466 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP1P29466 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP1P29466 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP1P29466 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP1P29466 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP1P29466 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP1P29466 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP1P29466 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP1P29466 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP1P29466 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP1P29466 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP1P29466 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP1P29466 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP1P29466 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP1P29466 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP1P29466 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP1P29466 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP1P29466 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP1P29466 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP1P29466 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP1P29466 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP1P29466 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP1P29466 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP1P29466 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP1P29466 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP1P29466 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP1P29466 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP1P29466 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP1P29466 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP1P29466 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP1P29466 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP1P29466 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP1P29466 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP1P29466 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP1P29466 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP1P29466 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP1P29466 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP1P29466 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP1P29466 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP1P29466 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP1P29466 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP1P29466 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP1P29466 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP1P29466 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP1P29466 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP1P29466 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP1P29466 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP1P29466 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP1P29466 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP1P29466 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP1P29466 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP1P29466 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CASP1P29466 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP1P29466 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP1P29466 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP1P29466 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP1P29466 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP1P29466 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP1P29466 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP1P29466 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP1P29466 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP1P29466 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP1P29466 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP1P29466 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP1P29466 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP1P29466 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP1P29466 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP1P29466 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP1P29466 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP1P29466 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP1P29466 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP1P29466 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP1P29466 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP1P29466 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP1P29466 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms