Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD34P28906 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD34P28906 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD34P28906 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD34P28906 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD34P28906 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD34P28906 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD34P28906 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD34P28906 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD34P28906 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD34P28906 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD34P28906 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD34P28906 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD34P28906 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD34P28906 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD34P28906 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD34P28906 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CD34P28906 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD34P28906 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD34P28906 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD34P28906 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD34P28906 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD34P28906 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD34P28906 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD34P28906 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD34P28906 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD34P28906 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD34P28906 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD34P28906 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD34P28906 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD34P28906 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD34P28906 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD34P28906 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD34P28906 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD34P28906 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD34P28906 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD34P28906 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD34P28906 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD34P28906 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD34P28906 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD34P28906 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD34P28906 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD34P28906 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD34P28906 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD34P28906 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CD34P28906 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CD34P28906 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CD34P28906 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CD34P28906 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CD34P28906 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CD34P28906 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CD34P28906 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CD34P28906 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CD34P28906 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CD34P28906 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CD34P28906 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CD34P28906 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CD34P28906 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CD34P28906 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CD34P28906 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CD34P28906 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CD34P28906 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CD34P28906 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CD34P28906 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CD34P28906 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD34P28906 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD34P28906 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD34P28906 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD34P28906 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD34P28906 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CD34P28906 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CD34P28906 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD34P28906 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CD34P28906 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD34P28906 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD34P28906 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD34P28906 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD34P28906 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD34P28906 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD34P28906 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD34P28906 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CD34P28906 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD34P28906 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD34P28906 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD34P28906 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD34P28906 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD34P28906 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD34P28906 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD34P28906 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD34P28906 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD34P28906 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD34P28906 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD34P28906 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD34P28906 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD34P28906 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD34P28906 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD34P28906 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD34P28906 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD34P28906 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD34P28906 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms