Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DUSP1P28562 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP1P28562 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP1P28562 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms