Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTSSP25774 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTSSP25774 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTSSP25774 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTSSP25774 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTSSP25774 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTSSP25774 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTSSP25774 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTSSP25774 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTSSP25774 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTSSP25774 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTSSP25774 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTSSP25774 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTSSP25774 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTSSP25774 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTSSP25774 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTSSP25774 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTSSP25774 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTSSP25774 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTSSP25774 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTSSP25774 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTSSP25774 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTSSP25774 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTSSP25774 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTSSP25774 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTSSP25774 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTSSP25774 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTSSP25774 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTSSP25774 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CTSSP25774 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTSSP25774 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTSSP25774 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTSSP25774 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTSSP25774 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTSSP25774 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTSSP25774 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTSSP25774 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTSSP25774 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTSSP25774 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTSSP25774 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTSSP25774 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTSSP25774 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTSSP25774 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTSSP25774 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTSSP25774 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTSSP25774 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTSSP25774 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CTSSP25774 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTSSP25774 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTSSP25774 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTSSP25774 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTSSP25774 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CTSSP25774 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTSSP25774 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTSSP25774 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTSSP25774 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTSSP25774 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTSSP25774 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTSSP25774 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTSSP25774 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTSSP25774 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTSSP25774 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTSSP25774 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTSSP25774 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CTSSP25774 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTSSP25774 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CTSSP25774 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTSSP25774 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTSSP25774 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTSSP25774 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTSSP25774 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTSSP25774 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTSSP25774 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTSSP25774 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTSSP25774 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTSSP25774 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTSSP25774 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTSSP25774 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTSSP25774 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTSSP25774 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CTSSP25774 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTSSP25774 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTSSP25774 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTSSP25774 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTSSP25774 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTSSP25774 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTSSP25774 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTSSP25774 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTSSP25774 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTSSP25774 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTSSP25774 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTSSP25774 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTSSP25774 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTSSP25774 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CTSSP25774 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTSSP25774 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTSSP25774 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTSSP25774 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTSSP25774 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTSSP25774 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 766.1 ms