Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMA1P25391 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA1P25391 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms