Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTNP21246 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTNP21246 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTNP21246 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTNP21246 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTNP21246 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PTNP21246 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PTNP21246 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTNP21246 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTNP21246 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTNP21246 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTNP21246 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTNP21246 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTNP21246 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTNP21246 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTNP21246 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTNP21246 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTNP21246 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTNP21246 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTNP21246 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTNP21246 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTNP21246 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTNP21246 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTNP21246 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTNP21246 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTNP21246 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTNP21246 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTNP21246 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTNP21246 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTNP21246 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTNP21246 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTNP21246 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTNP21246 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTNP21246 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTNP21246 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTNP21246 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTNP21246 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTNP21246 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTNP21246 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTNP21246 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PTNP21246 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTNP21246 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTNP21246 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTNP21246 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTNP21246 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTNP21246 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTNP21246 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTNP21246 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTNP21246 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTNP21246 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTNP21246 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTNP21246 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTNP21246 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTNP21246 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTNP21246 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTNP21246 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTNP21246 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTNP21246 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTNP21246 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTNP21246 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTNP21246 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTNP21246 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTNP21246 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTNP21246 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTNP21246 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTNP21246 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTNP21246 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTNP21246 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTNP21246 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTNP21246 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTNP21246 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTNP21246 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTNP21246 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTNP21246 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTNP21246 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTNP21246 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTNP21246 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTNP21246 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTNP21246 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTNP21246 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTNP21246 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTNP21246 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTNP21246 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTNP21246 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTNP21246 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTNP21246 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTNP21246 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTNP21246 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTNP21246 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTNP21246 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTNP21246 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTNP21246 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTNP21246 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTNP21246 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTNP21246 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTNP21246 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTNP21246 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTNP21246 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTNP21246 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTNP21246 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms