Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDCP20941 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDCP20941 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDCP20941 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDCP20941 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PDCP20941 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDCP20941 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDCP20941 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDCP20941 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDCP20941 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDCP20941 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDCP20941 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDCP20941 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDCP20941 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PDCP20941 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDCP20941 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDCP20941 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDCP20941 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDCP20941 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDCP20941 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDCP20941 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDCP20941 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDCP20941 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDCP20941 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDCP20941 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDCP20941 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDCP20941 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDCP20941 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDCP20941 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDCP20941 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDCP20941 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDCP20941 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PDCP20941 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDCP20941 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PDCP20941 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDCP20941 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDCP20941 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDCP20941 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDCP20941 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDCP20941 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDCP20941 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDCP20941 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDCP20941 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDCP20941 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDCP20941 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDCP20941 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDCP20941 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDCP20941 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PDCP20941 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDCP20941 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDCP20941 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PDCP20941 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDCP20941 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDCP20941 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDCP20941 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDCP20941 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDCP20941 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDCP20941 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDCP20941 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDCP20941 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDCP20941 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PDCP20941 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDCP20941 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PDCP20941 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PDCP20941 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PDCP20941 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDCP20941 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDCP20941 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDCP20941 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDCP20941 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDCP20941 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDCP20941 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDCP20941 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDCP20941 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDCP20941 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDCP20941 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDCP20941 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDCP20941 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDCP20941 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDCP20941 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDCP20941 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDCP20941 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDCP20941 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDCP20941 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PDCP20941 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDCP20941 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDCP20941 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDCP20941 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDCP20941 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PDCP20941 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PDCP20941 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDCP20941 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDCP20941 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDCP20941 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDCP20941 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDCP20941 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDCP20941 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDCP20941 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDCP20941 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDCP20941 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms