Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASTP20810 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASTP20810 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CASTP20810 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASTP20810 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASTP20810 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASTP20810 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASTP20810 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASTP20810 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASTP20810 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASTP20810 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASTP20810 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASTP20810 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASTP20810 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASTP20810 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASTP20810 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASTP20810 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASTP20810 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASTP20810 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASTP20810 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASTP20810 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASTP20810 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASTP20810 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CASTP20810 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASTP20810 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASTP20810 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASTP20810 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CASTP20810 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CASTP20810 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CASTP20810 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CASTP20810 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CASTP20810 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CASTP20810 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CASTP20810 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CASTP20810 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASTP20810 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASTP20810 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASTP20810 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASTP20810 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASTP20810 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CASTP20810 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASTP20810 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CASTP20810 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASTP20810 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASTP20810 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASTP20810 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASTP20810 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASTP20810 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASTP20810 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASTP20810 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASTP20810 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASTP20810 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASTP20810 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASTP20810 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASTP20810 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASTP20810 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASTP20810 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASTP20810 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASTP20810 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASTP20810 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASTP20810 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CASTP20810 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASTP20810 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASTP20810 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASTP20810 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASTP20810 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASTP20810 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASTP20810 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CASTP20810 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASTP20810 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASTP20810 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASTP20810 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASTP20810 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASTP20810 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASTP20810 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASTP20810 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASTP20810 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASTP20810 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CASTP20810 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CASTP20810 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CASTP20810 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CASTP20810 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CASTP20810 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CASTP20810 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASTP20810 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CASTP20810 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASTP20810 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASTP20810 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASTP20810 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASTP20810 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASTP20810 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASTP20810 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASTP20810 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASTP20810 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASTP20810 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASTP20810 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASTP20810 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASTP20810 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASTP20810 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASTP20810 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms