Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HLA-DPA1P20036 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DPA1P20036 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DPA1P20036 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms