Protein–RNA interactions for Protein: P18887

XRCC1, DNA repair protein XRCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC1P18887 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
XRCC1P18887 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XRCC1P18887 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XRCC1P18887 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XRCC1P18887 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XRCC1P18887 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XRCC1P18887 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XRCC1P18887 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XRCC1P18887 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
XRCC1P18887 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XRCC1P18887 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XRCC1P18887 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XRCC1P18887 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XRCC1P18887 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XRCC1P18887 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XRCC1P18887 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XRCC1P18887 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XRCC1P18887 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XRCC1P18887 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XRCC1P18887 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XRCC1P18887 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XRCC1P18887 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XRCC1P18887 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XRCC1P18887 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XRCC1P18887 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XRCC1P18887 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
XRCC1P18887 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XRCC1P18887 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XRCC1P18887 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC1P18887 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms