Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCC1P18754 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCC1P18754 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCC1P18754 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCC1P18754 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RCC1P18754 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCC1P18754 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCC1P18754 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCC1P18754 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCC1P18754 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCC1P18754 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RCC1P18754 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
RCC1P18754 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RCC1P18754 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RCC1P18754 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RCC1P18754 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RCC1P18754 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RCC1P18754 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RCC1P18754 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RCC1P18754 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RCC1P18754 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RCC1P18754 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RCC1P18754 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RCC1P18754 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RCC1P18754 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RCC1P18754 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RCC1P18754 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RCC1P18754 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RCC1P18754 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RCC1P18754 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RCC1P18754 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RCC1P18754 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RCC1P18754 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RCC1P18754 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RCC1P18754 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RCC1P18754 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RCC1P18754 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RCC1P18754 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RCC1P18754 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RCC1P18754 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RCC1P18754 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RCC1P18754 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RCC1P18754 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RCC1P18754 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RCC1P18754 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RCC1P18754 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RCC1P18754 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RCC1P18754 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RCC1P18754 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RCC1P18754 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RCC1P18754 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RCC1P18754 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RCC1P18754 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RCC1P18754 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RCC1P18754 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RCC1P18754 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RCC1P18754 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RCC1P18754 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RCC1P18754 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RCC1P18754 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RCC1P18754 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RCC1P18754 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RCC1P18754 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RCC1P18754 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RCC1P18754 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RCC1P18754 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RCC1P18754 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RCC1P18754 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RCC1P18754 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RCC1P18754 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RCC1P18754 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RCC1P18754 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RCC1P18754 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RCC1P18754 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RCC1P18754 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RCC1P18754 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RCC1P18754 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RCC1P18754 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RCC1P18754 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RCC1P18754 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RCC1P18754 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RCC1P18754 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RCC1P18754 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RCC1P18754 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RCC1P18754 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RCC1P18754 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RCC1P18754 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RCC1P18754 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RCC1P18754 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RCC1P18754 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RCC1P18754 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RCC1P18754 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RCC1P18754 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RCC1P18754 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RCC1P18754 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RCC1P18754 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RCC1P18754 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RCC1P18754 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RCC1P18754 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RCC1P18754 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms