Protein–RNA interactions for Protein: P18084

ITGB5, Integrin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5P18084 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGB5P18084 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGB5P18084 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGB5P18084 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms