Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMD1P17707 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMD1P17707 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMD1P17707 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMD1P17707 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMD1P17707 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMD1P17707 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMD1P17707 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMD1P17707 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMD1P17707 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMD1P17707 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AMD1P17707 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMD1P17707 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMD1P17707 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMD1P17707 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMD1P17707 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMD1P17707 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMD1P17707 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMD1P17707 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMD1P17707 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMD1P17707 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMD1P17707 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMD1P17707 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMD1P17707 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMD1P17707 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMD1P17707 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMD1P17707 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMD1P17707 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMD1P17707 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMD1P17707 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMD1P17707 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMD1P17707 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
AMD1P17707 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMD1P17707 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMD1P17707 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMD1P17707 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMD1P17707 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMD1P17707 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMD1P17707 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMD1P17707 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMD1P17707 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AMD1P17707 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMD1P17707 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AMD1P17707 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMD1P17707 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMD1P17707 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMD1P17707 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMD1P17707 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMD1P17707 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMD1P17707 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMD1P17707 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
AMD1P17707 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMD1P17707 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMD1P17707 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMD1P17707 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMD1P17707 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMD1P17707 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMD1P17707 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMD1P17707 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMD1P17707 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMD1P17707 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMD1P17707 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMD1P17707 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMD1P17707 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMD1P17707 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMD1P17707 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMD1P17707 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMD1P17707 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMD1P17707 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMD1P17707 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMD1P17707 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMD1P17707 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMD1P17707 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMD1P17707 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMD1P17707 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMD1P17707 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMD1P17707 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMD1P17707 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMD1P17707 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMD1P17707 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMD1P17707 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMD1P17707 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMD1P17707 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMD1P17707 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMD1P17707 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMD1P17707 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AMD1P17707 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMD1P17707 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMD1P17707 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMD1P17707 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMD1P17707 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMD1P17707 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMD1P17707 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMD1P17707 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMD1P17707 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMD1P17707 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMD1P17707 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMD1P17707 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMD1P17707 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMD1P17707 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms