Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYN1P17600 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYN1P17600 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYN1P17600 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYN1P17600 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYN1P17600 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYN1P17600 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYN1P17600 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYN1P17600 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYN1P17600 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYN1P17600 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYN1P17600 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYN1P17600 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYN1P17600 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYN1P17600 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYN1P17600 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYN1P17600 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYN1P17600 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYN1P17600 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYN1P17600 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYN1P17600 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYN1P17600 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYN1P17600 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYN1P17600 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYN1P17600 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYN1P17600 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYN1P17600 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYN1P17600 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYN1P17600 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYN1P17600 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYN1P17600 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYN1P17600 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SYN1P17600 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYN1P17600 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SYN1P17600 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYN1P17600 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYN1P17600 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYN1P17600 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYN1P17600 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYN1P17600 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYN1P17600 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SYN1P17600 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYN1P17600 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYN1P17600 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYN1P17600 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYN1P17600 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYN1P17600 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYN1P17600 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYN1P17600 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYN1P17600 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYN1P17600 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYN1P17600 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SYN1P17600 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYN1P17600 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYN1P17600 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYN1P17600 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYN1P17600 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYN1P17600 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYN1P17600 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYN1P17600 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYN1P17600 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYN1P17600 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYN1P17600 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SYN1P17600 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYN1P17600 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYN1P17600 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYN1P17600 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SYN1P17600 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYN1P17600 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYN1P17600 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYN1P17600 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYN1P17600 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYN1P17600 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYN1P17600 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYN1P17600 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYN1P17600 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SYN1P17600 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYN1P17600 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYN1P17600 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYN1P17600 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SYN1P17600 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYN1P17600 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SYN1P17600 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SYN1P17600 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYN1P17600 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYN1P17600 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYN1P17600 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYN1P17600 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYN1P17600 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYN1P17600 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYN1P17600 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYN1P17600 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYN1P17600 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SYN1P17600 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYN1P17600 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SYN1P17600 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYN1P17600 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYN1P17600 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYN1P17600 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYN1P17600 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms