Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKMT2P17540 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms