Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GCFC2P16383 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCFC2P16383 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms