Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GATA1P15976 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATA1P15976 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATA1P15976 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATA1P15976 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATA1P15976 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATA1P15976 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATA1P15976 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GATA1P15976 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATA1P15976 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATA1P15976 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATA1P15976 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATA1P15976 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATA1P15976 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATA1P15976 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATA1P15976 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATA1P15976 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATA1P15976 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATA1P15976 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GATA1P15976 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GATA1P15976 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GATA1P15976 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GATA1P15976 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GATA1P15976 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATA1P15976 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATA1P15976 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATA1P15976 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATA1P15976 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATA1P15976 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATA1P15976 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATA1P15976 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATA1P15976 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA1P15976 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA1P15976 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA1P15976 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA1P15976 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA1P15976 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA1P15976 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA1P15976 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA1P15976 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA1P15976 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA1P15976 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA1P15976 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA1P15976 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA1P15976 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA1P15976 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA1P15976 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA1P15976 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA1P15976 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA1P15976 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA1P15976 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA1P15976 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA1P15976 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA1P15976 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA1P15976 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA1P15976 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA1P15976 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA1P15976 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA1P15976 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA1P15976 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA1P15976 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA1P15976 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA1P15976 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA1P15976 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA1P15976 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA1P15976 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA1P15976 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA1P15976 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA1P15976 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA1P15976 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA1P15976 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA1P15976 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA1P15976 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA1P15976 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA1P15976 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA1P15976 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA1P15976 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA1P15976 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA1P15976 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA1P15976 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA1P15976 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA1P15976 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA1P15976 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA1P15976 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATA1P15976 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATA1P15976 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATA1P15976 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATA1P15976 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATA1P15976 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATA1P15976 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATA1P15976 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATA1P15976 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATA1P15976 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GATA1P15976 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GATA1P15976 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA1P15976 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA1P15976 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA1P15976 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA1P15976 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATA1P15976 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms