Protein–RNA interactions for Protein: P15559

NQO1, NAD(P)H dehydrogenase [quinone] 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NQO1P15559 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NQO1P15559 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NQO1P15559 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NQO1P15559 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NQO1P15559 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NQO1P15559 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NQO1P15559 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NQO1P15559 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NQO1P15559 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NQO1P15559 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NQO1P15559 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NQO1P15559 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NQO1P15559 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NQO1P15559 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NQO1P15559 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NQO1P15559 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NQO1P15559 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NQO1P15559 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NQO1P15559 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NQO1P15559 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NQO1P15559 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NQO1P15559 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NQO1P15559 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NQO1P15559 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NQO1P15559 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NQO1P15559 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NQO1P15559 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NQO1P15559 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NQO1P15559 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NQO1P15559 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NQO1P15559 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NQO1P15559 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NQO1P15559 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NQO1P15559 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NQO1P15559 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NQO1P15559 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NQO1P15559 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NQO1P15559 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NQO1P15559 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NQO1P15559 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NQO1P15559 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NQO1P15559 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NQO1P15559 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NQO1P15559 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NQO1P15559 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NQO1P15559 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NQO1P15559 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NQO1P15559 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NQO1P15559 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NQO1P15559 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NQO1P15559 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NQO1P15559 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NQO1P15559 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NQO1P15559 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NQO1P15559 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NQO1P15559 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NQO1P15559 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NQO1P15559 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NQO1P15559 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NQO1P15559 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NQO1P15559 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NQO1P15559 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NQO1P15559 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NQO1P15559 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NQO1P15559 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NQO1P15559 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NQO1P15559 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NQO1P15559 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NQO1P15559 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NQO1P15559 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NQO1P15559 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NQO1P15559 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NQO1P15559 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NQO1P15559 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NQO1P15559 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NQO1P15559 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NQO1P15559 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NQO1P15559 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NQO1P15559 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NQO1P15559 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NQO1P15559 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NQO1P15559 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NQO1P15559 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NQO1P15559 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NQO1P15559 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NQO1P15559 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NQO1P15559 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NQO1P15559 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NQO1P15559 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NQO1P15559 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NQO1P15559 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NQO1P15559 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NQO1P15559 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NQO1P15559 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NQO1P15559 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NQO1P15559 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NQO1P15559 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NQO1P15559 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NQO1P15559 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NQO1P15559 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms