Protein–RNA interactions for Protein: P15514

AREG, Amphiregulin, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AREGP15514 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AREGP15514 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AREGP15514 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AREGP15514 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AREGP15514 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AREGP15514 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AREGP15514 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AREGP15514 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AREGP15514 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AREGP15514 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AREGP15514 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AREGP15514 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AREGP15514 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AREGP15514 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AREGP15514 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AREGP15514 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AREGP15514 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AREGP15514 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AREGP15514 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AREGP15514 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AREGP15514 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AREGP15514 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AREGP15514 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AREGP15514 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AREGP15514 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AREGP15514 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AREGP15514 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AREGP15514 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AREGP15514 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AREGP15514 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
AREGP15514 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AREGP15514 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AREGP15514 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
AREGP15514 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AREGP15514 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AREGP15514 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AREGP15514 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AREGP15514 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AREGP15514 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AREGP15514 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
AREGP15514 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AREGP15514 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AREGP15514 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AREGP15514 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AREGP15514 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AREGP15514 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AREGP15514 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AREGP15514 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AREGP15514 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AREGP15514 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AREGP15514 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AREGP15514 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AREGP15514 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AREGP15514 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AREGP15514 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AREGP15514 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AREGP15514 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AREGP15514 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AREGP15514 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AREGP15514 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AREGP15514 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AREGP15514 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AREGP15514 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AREGP15514 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AREGP15514 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AREGP15514 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AREGP15514 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AREGP15514 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AREGP15514 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AREGP15514 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AREGP15514 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AREGP15514 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AREGP15514 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AREGP15514 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AREGP15514 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AREGP15514 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AREGP15514 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AREGP15514 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AREGP15514 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AREGP15514 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AREGP15514 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AREGP15514 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
AREGP15514 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AREGP15514 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AREGP15514 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AREGP15514 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AREGP15514 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AREGP15514 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AREGP15514 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AREGP15514 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AREGP15514 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AREGP15514 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AREGP15514 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AREGP15514 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AREGP15514 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AREGP15514 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AREGP15514 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AREGP15514 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AREGP15514 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AREGP15514 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms