Protein–RNA interactions for Protein: P15374

UCHL3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCHL3P15374 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UCHL3P15374 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UCHL3P15374 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms