Protein–RNA interactions for Protein: P15172

MYOD1, Myoblast determination protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOD1P15172 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
MYOD1P15172 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MYOD1P15172 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms